對組成復雜的樣品，若待測離子對樹脂親合力相差頗大，就要作幾次進樣，并用不同濃度或強度的淋洗液或梯度淋洗。對固定相親合力差異較大的離子，增加分離度的較簡單方法是稀釋樣品或作樣品前處理。例如鹽水中SO2-4和Cl-的分離。若直接進樣，其色譜峰很寬而且拖尾，表明進樣量已超過分離柱容量，在常用的分析陰離子的色譜條件下，30min之后Cl-的洗脫仍在繼續。在這種情況下，在未恢復穩定基線之前不能再進樣。若將樣品稀釋10倍之后再進樣就可得到Cl-與痕量SO2-4之間的較好分離。對陰離子分析推薦的較大進樣量，一般為柱容量的30%，超過這個范圍就會出現大的平頭峰或肩峰

　　離子色譜中改變分離和檢測方式：

　　若待測離子對固定相親合力相近或相同，樣品稀釋的效果常不令人滿意。對這種情況，除了選擇適當的流動相之外，還應考慮選擇適當的分離方式和檢測方式。例如，NO-3和ClO-3，由于它們的電荷數和離子半徑相似，在陰離子交換分離柱上共淋洗。但ClO-3的疏水性大于NO-3，在離子對色譜柱上就很容易分開。又如NO-2與Cl-在陰離子交換分離柱上的保留時間相近，常見樣品中Cl-的濃度又遠大于NO-2，使分離更加困難，但NO-2有強的UV吸收，而Cl-則很弱，因此，應改用紫外作檢測器測定NO-2，用電導檢測Cl-，或將兩種檢測器串聯，于一次進樣同時檢測Cl-與NO-2。對高濃度強酸中有機酸的分析，若采用離子排斥，由于強酸不被保留，在死體積排除，將不干擾有機酸的分離。